Hadoop的BAM 5.1_Hadoop-BAM 5.1

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运行环境:WinXP/Win7/Win8/Win10/Win All
软件语言:简体中文
软件类型:国产软件 - 编程软件
授权方式:共享版
软件大小:998 KB
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联系方式:暂无联系方式
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更新时间:2013-03-09 12:27:00
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Hadoop的BAM 5.1_Hadoop-BAM 5.1软件简介

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  • Java库,以提高您的工作

    Hadoop的BAM创建一个开源的,基于Java的库的遗传数据进行分布式处理下一代测序机。

    它允许对齐读的Hadoop分布式计算框架的可扩展性操作。它可以作为一个集成层分析应用软件和BAM(二进位校准/地图)使用Hadoop处理的神器出山:www.shenqi73.com文件,这些文件。

    Hadoop的BAM解决的问题提出了方便的API实现地图的BAM数据访问的相关,并减少在Hadoop的Map-reduce架构的功能。

    顶部流行的皮卡德SAM-JDK库的基础上,因此,依靠的皮卡德API上的工具,可以很容易地转换为支持大规模分布式处理。

    要求:

    ·的Java

    此版本中的新功能:

    ·删除了fi.tkk.ics.hadoop.bam.util.hadoop.BAMReader和fi.tkk.ics.hadoop.bam.util.hadoop.BAMSort的类,被废弃在3.0。
    ·重大变化:命令行插件'排序','总结',和'summarysort“现在默认为1 reduce任务。用量可定制
    ·与的-r/--reducers命令行参数。这颠簸起来的插件的版本为4.0,3.0和2.0分别。
    ·修正:取消映射键BAMRecordReader.getKey现在哈希而不是随机它们,以确保一致的结果。
    ·对于兼容性与Hadoop 2.0和任何未来的Hadoop发行版中,自定义
    ·Hadoop的类现在只有建立和使用时使用的Hadoop发行版
    ·不为他们提供。这意味着,错误MapReduce的1987年,
    ·MapReduce的2538,这是以前固定,可能会造成问题,具有一定的减速计数时使用的MapReduce使用命令行插件。
    ·修正了一些BAM引起由fi.tkk.ics.hadoop.bam.BAMSplitGuesser中的错误。
    ·修正了一些Illumina的IDE ...


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