Hadoop的BAM 5.1_Hadoop-BAM 5.1下载地址

Java库，以提高您的工作

Hadoop的BAM创建一个开源的，基于Java的库的遗传数据进行分布式处理下一代测序机。

它允许对齐读的Hadoop分布式计算框架的可扩展性操作。它可以作为一个集成层分析应用软件和BAM（二进位校准/地图）使用Hadoop处理的神器出山:www.shenqi73.com文件，这些文件。

Hadoop的BAM解决的问题提出了方便的API实现地图的BAM数据访问的相关，并减少在Hadoop的Map-reduce架构的功能。

顶部流行的皮卡德SAM-JDK库的基础上，因此，依靠的皮卡德API上的工具，可以很容易地转换为支持大规模分布式处理。

要求：

·的Java

此版本中的新功能：

·删除了fi.tkk.ics.hadoop.bam.util.hadoop.BAMReader和fi.tkk.ics.hadoop.bam.util.hadoop.BAMSort的类，被废弃在3.0。
·重大变化：命令行插件'排序'，'总结'，和'summarysort“现在默认为1 reduce任务。用量可定制
·与的-r/--reducers命令行参数。这颠簸起来的插件的版本为4.0，3.0和2.0分别。
·修正：取消映射键BAMRecordReader.getKey现在哈希而不是随机它们，以确保一致的结果。
·对于兼容性与Hadoop 2.0和任何未来的Hadoop发行版中，自定义
·Hadoop的类现在只有建立和使用时使用的Hadoop发行版
·不为他们提供。这意味着，错误MapReduce的1987年，
·MapReduce的2538，这是以前固定，可能会造成问题，具有一定的减速计数时使用的MapReduce使用命令行插件。
·修正了一些BAM引起由fi.tkk.ics.hadoop.bam.BAMSplitGuesser中的错误。
·修正了一些Illumina的IDE ...