PEAKS Studio 6.0中生成20120620_PEAKS Studio 6.0 Build 20120620

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一个完整的蛋白质组学软件用于获得准确，灵敏的肽鉴定结果

PEAKS工作室是一个用户友好的应用程序，尤其是研究人员设计的。这使他们能够获得准确的结果时，研究编序的有机体。

实际上，它是一种蛋白质质谱的软件，它使用一个de novo测序方法。然后，用户可以使用集成的神器出山:www.shenqi73.com的PTM识别工具，以识别任何翻译后修饰，或天基信息平台工具，以识别任何可能的肽突变。

仅在蛋白质序列数据库搜索，而是的PEAKS集成了四种不同的算法来识别数据库肽，肽新颖，翻译后修饰及突变肽的数据。

所有这些分析都是在一个自动化的工作流程，并且不需要用户干预。所有的识别出肽（连同突变和翻译后修饰）对齐，突出的覆盖范围和可能的突变和为每个单个氨基酸的蛋白质的翻译后修饰的蛋白质覆盖窗格。

从最后的结果验证，可视化和报告的原始质谱数据，PEAKS整个过程简单而直接的。默认的分析工作流程和内置的结果验证让即使是初学者也可以轻松地分析数据并生成高质量的结果。

同时，精心设计的可视化界面，使高级用户自发地检查每一个识别的算法，个别峰的每一个单氨基酸支持的特性的细节。最后的结果可以很容易地导出到HTML和各种文本格式发布，成果共享和后处理。


注意：为了获得试用版密钥，用户需要访问的链接

下面是一些主要特点”PEAKS工作室“：

从头测序：
·序列肽没有一个数据库，并有可能确定新的数据库中不存在任何的肽

PEAKS DB：
·准确和敏感的肽识别和蛋白质测序与内置的FDR结果验证。

inChorus：
·测试的几个引擎和验证结果

PEAKS PTM：
·手动开启任何内置的翻译后修饰，或用户可以做一个盲目的的PTM搜索结果在所有650 +的翻译后修饰。

蜘蛛：
·序列标签同源性搜索，以找出任何潜在的基因突变的结果

PEAKS Q：
·执行准确的蛋白定量

要求：

·4 GB RAM

限制：

·30天试用版

本发行版中的新功能：

互动蛋白质覆盖率查看：
·在该图形显示中，被映射到识别的蛋白质的所有肽的蛋白质序列。翻译后修饰及突变都会高亮显示，，个别肽谱匹配通过简单的鼠标点击，可以进行检查。

翻译后修饰的盲目搜索：
·用户可以打开所有（650多个）变量的翻译后修饰在Unimod数据库，并让软件找到什么样的翻译后修饰存在。

简单的工作流程，全面分析：
·简化识别修饰，突变，小说和数据库的肽都在一个统一的视图。

支持多种酶：
一个项目可以包含多个样本，每个不同的蛋白水解酶。从不同的酶消化的重叠肽的蛋白质覆盖率最大化。

算法的改进：
·新的非特异性酶消化的支持。现在，人们可以允许非特异性内切酶消化，在0，1，或两端的肽。有更多的非特异性消化结束，将提高搜索的灵敏度降低小号...