CBCAnalyzer 2.0.0

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CBCAnalyzer 2.0.0

推断系统发育的基础上补偿碱基变化（CBCS）

开发

在CBCAnalyzer（CBC补偿碱基变化）是一个自定义编写的软件工具箱，由三部分组成，CTTransform，CBCDetect，并CBCTree的。 CTTransform读取几个CT-文件格式（克拉RNAviz克拉或Mac克拉），并产生一个所谓的神器出山:www.shenqi73.com“支架点支架”的格式，通常用来作为其他工具，如RNAforester，RNAmovie或MARNA输入。 ;

后者的一个创建了一个基于对初级序列和二级结构，现在可以用作输入CBCDetect的的多个对准。在此我们为全血球计数，对所有的序列，这是非常重要的，在检测种类，歧视他们的性的不兼容。

的计数（距离）矩阵获得人CBCDetect的用作输入CBCTree重建phylogram通过使用BIONJ算法。

注意：
非商业用途CBCAnalyzer可以自由地

下面是一些主要特点“CBCAnalyzer”：

·新增的距离矩阵“halfCBCs”和“全血球+ halfCBCs的”
·移植到Qt的图形用户界面
·CBCAnalyzer现在运行在Mac OS X
·本RNAForester的格式，不再支持
·CBC检测，现在也接受的路线扩展FASTA格式